物質界／渋谷・交差点
有栖零児＆小牟、シオン・ウヅキ＆M.O.M.O.、KOS-MOS、春麗
“ゆらぎ”の調査のため、渋谷を訪れた零児と小牟。そんな二人の前に巨大な“ゆらぎ”が生じ、人類の敵と呼ばれるべき存在、グノーシスが転移してくる。 そのグノーシスを追うように転移してくるシオン、M.O.M.O.、KOS-MOS。零児はシオンたちと共闘することになるが、そこにはシャドルーのベガ親衛隊と、それを追う春麗までもが登場する。
幻想界/ドルアーガの塔・廃墟跡
スタン・エルロン＆ルーティ・カトレット、クロノア＆ガンツ、クリノ＆サビーヌ、ギルガメス＆カイ
廃墟と化したドルアーガの塔の前でルーティとスタンは黄金の騎士を待っていた。 しかし、そこにはギルガメスの代わりにモンスターが出現。その場に駆けつけたクロノア＆ガンツ、クリノ＆サビーヌと協力して戦うことになるが、更なる敵が出現して…
魍魎界／上ノ伊城・桜台門
御剣平四郎、タキ、トビ・マスヨ＆天現寺ひろみ、トロンにコブン、平景清＆たろすけ
邪剣ソウルエッジが上ノ伊城に出現。なにやら源氏の武士、源義経がその存在を狙っているらしい。ソウルエッジを巡り、御剣、タキと戦闘に入るが、ここでも“ゆらぎ”が生じ、マスヨにひろみ、トロンにコブンが時空転移してくる。さらには義経を追って景清とたろすけが。ソウルエッジは果たして誰の手に落ちるのか？
魔界／魔界村・エントランス
ワルキューレ、モリガン=アーンスランド、デミトリ=マキシモフ
女神イシターの命令を受け、魔界村へと赴くワルキューレ。しかし、魔界村は空間がゆがめられており、一定の場所から先へと進むことができない。次々と出現する魔物にワルキューレの体力が消耗したとき、偶然にもデミトリとモリガンが現れる。お互いの目的は違うが、目指す場所は同じ、3人は共闘することととなる。果たして魔界村で今、何が起こっているのか…！？
物質界／スペンサーレイン号・プールデッキ
鳳鈴＆レイレイ、ブルース・マッギャヴァン＆レジーナ、リュウ、ケン・マスターズ、風間仁
とある機密データを入手するためスペンサーレイン号に乗り込んだブルースと鳳鈴だが、突然船がザベル率いるモンスターに襲われる。同じく機密データを狙う工作員レジーナと、偶然船に乗り合わせたキョンシーのレイレイ、リュウ、ケン、仁らと協力してザベルを撃破することになる！
CHARACTERS&SOUND:
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©MOTO KIKAKU.
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ゲーム画面は開発中のものです
